不得不说，对比起第二次远征“弘安之役”，第一次远征“文永之役”中拥有太多谜团。日本、高丽、元朝史料中有非常多的分歧。
在《元史》中完全没有提及“大风雨”之说，并且仅经过半月时间，面对为数不多的日军就“矢尽”并不合理，再者东征军将领忻都等人也因“入其国，败之......惟掳掠四境而归。”而获得了封赏。高丽方面侍中金方庆等“还师忽敦以所俘童男女二百人献王及公女”也受到封赏。这其中也许有东征军瞒报战情的可能性，但也不乏史料记载错误的可能。
《高丽史》中“会夜大风雨，战舰触崖壁，多败，侁堕水死。” 与 “军不还者无虑万三千五百余人。”里面明确记载了当时有大风雨与伤亡的发生。但《高丽史》成书于 1451 年的李氏朝鲜，距离“文永之役”已相隔将近二百年，其中有关暴风雨记载的史料难以考证，或许与“弘安之役”有所混淆。
日本的《八幡愚童训》虽也有“顷刻间海面便巨浪滔天，敌军全部葬身鱼腹。”的东征军遭遇风暴的情况，但引起风暴的却是“八幡大菩萨于十月二十日夜间化身为白衣神将，率三千神兵由箱崎八幡宫出发，朝敌国舰队发 射神箭。”并不具有太多参考价值。
日本最具有参考价值的一份史料来自于《蒙古袭来绘词》。 绘词所描绘的是亲历这两场战役的下级武士竹崎季长。绘词多为九州肥后国御家人竹崎季长的个人战绩，为祈求神明庇佑，并且向幕府汇报战功，他请画师将自己的战役经历制成《蒙古袭来绘词》。虽有夸大战功的可能性，但《蒙古袭来绘词》 仍然是时间最早、可信度最高的如实表现当时元日战争的史料记载。然而《蒙古袭来绘词·前卷·文永之役》中并未有记载东征军遭遇“大风雨”之说。
